La mort de Fals Dmitry no va aturar els problemes. La guerra civil va continuar, cobrint noves terres, van aparèixer nous impostors. El primer mes del seu regnat, Vasily Shuisky va haver de suprimir diversos intents d'actuacions de les classes inferiors urbanes de Moscou. A Moscou, temien que el rei polonès Sigismund iniciés una guerra pel derrocament de l’impostor i la pallissa dels polonesos. Per tant, dels diversos milers de convidats i mercenaris polonesos de Fals Dmitri que van sobreviure a la revolta de maig a Moscou, només els plebeus van ser alliberats i la gent noble va quedar com a ostatges, amb un bon manteniment i distribuïts sota supervisió a diferents ciutats. Shuisky va violar l'etiqueta diplomàtica i fins i tot va detenir l'ambaixada polonesa de Gonsevsky a Moscou.
No obstant això, aquestes pors van ser en va. La mateixa Polònia va tenir dificultats. Els polonesos van iniciar una guerra amb Suècia i van recuperar la ciutat de Pernov (Pärnu) a Livònia. A més, els cosacs de Zaporozhye, dirigits per Hetman Sagaidachny, van dur a terme diverses incursions amb èxit i van saquejar Kafa i Varna. Això va enfadar els otomans i van declarar la guerra a la Mancomunitat. És cert que les principals forces de l'exèrcit turc es van associar a la guerra amb Pèrsia i es van enviar tropes auxiliars contra Polònia i els polonesos van rebutjar l'atac. A la mateixa Polònia, alguns dels magnats insatisfets amb la política del rei van provocar furor. El país va quedar embolicat en una guerra civil. Per tant, els polonesos no tenien temps per a Moscou.
Així, Moscou va passar per alt una amenaça més seriosa: la interna. Al cap i a la fi, els problemes que van provocar els problemes no es van resoldre. I l’amenaça externa va jugar un paper important, però no el principal. La província estava indignada: la Duma Boyar va escollir un tsar sense el suport necessari de totes les terres. Va resultar que els boiars van matar el "bon tsar" i van prendre el poder, lliurant el tron al "tsar boiar". La província bullia: el terme de cerca de fugitius va augmentar a 15 anys; els militars van recordar els generosos premis de False Dmitry; els habitants del sud temien represàlies i terror (com sota Godunov) per ajudar a l'impostor; preocupat pels cosacs, que donaven suport activament al mentider; Shuisky es va desfer dels partidaris de Fals Dmitry, enviant-los fora de la capital, molts van ser enviats a les fronteres del sud.
L’estiu del 1606, revoltes espontànies van assolar tot el sud del país, cosa que va ser agitada pels rumors sobre “la salvació del bon tsar Dmitry”. El centre de la lluita contra el nou rei a la Terra del Nord va ser la "capital" del primer impostor: Putivl. Aquí, els camperols insurgents, els camperols, van escollir Ivan Bolotnikov, que havia vingut amb ells amb un destacament, com a "gran comandant". Ivan Bolotnikov, segons la versió més estesa, era serf del príncep Telyatevsky. En la seva joventut, va fugir del seu amo a l'estepa cap als cosacs, aquí va ser capturat pels tàtars i va ser venut com a esclau als turcs. Va passar diversos anys a l'esclavitud, a les galeres com a remer. Després d'una fallida batalla naval amb vaixells cristians per als turcs, va ser alliberat i es va dirigir a Venècia, on vivia en un recinte comercial alemany. A partir d’aquí, després d’haver escoltat històries sobre el començament dels problemes a l’estat rus, Bolotnikov es va traslladar a Alemanya i Polònia a Rússia. Els rumors sobre la "salvació miraculosa" del tsar de Moscou Dmitry van atreure Ivan a Sambor, on el fugitiu de Moscou Mikhail Molchanov, antic aliat del fals Dmitry I. Molchanov, s'amagava amb la seva dona Yuri Mnishek Yadviga, i es va presentar com a rei. Aquest aventurer es va presentar a Bolotnikov com un tsar que havia escapat després del cop d’estat de maig a Moscou. El nou impostor va parlar durant molt de temps amb Bolotnikov i, a continuació, li va proporcionar una carta al príncep Grigory Shakhovsky i el va enviar a Putivl com a emissari personal i "gran voivoda".
De fet, la guerra civil ha entrat en una fase activa. L’exèrcit de Bolotnikov incloïa els principals estaments i grups socials de l’estat rus: camperols i esclaus, els cosacs de Seversk, Terek, Volga i Zaporozhye, representants de la noblesa. A més, l'aixecament va comptar amb el suport de representants de l'aristocràcia, entre ells el príncep Grigory Shakhovsky i el voivoda de Txernigov Andrei Telyatevsky, l'antic propietari de Bolotnikov.
L'estiu del 1606, 30 milers. L'exèrcit de Bolotnikov es va traslladar a Moscou. Es van capturar les fortaleses de Kromy i Yelets, els rics arsenals dels quals van reposar les reserves dels rebels. Les tropes governamentals sota el comandament dels governadors dels prínceps Vorotynsky i Trubetskoy van ser derrotats a Kromy i Yelets. Molts soldats de les tropes tsaristes van passar al bàndol dels rebels. Aprofitant els errors dels governadors tsaristes, els rebels van avançar ràpidament cap a Moscou. Cada vegada hi ha més destacaments de camperols rebels abocats a l'exèrcit de Bolotnikov. A més, de camí a Moscou, grans destacaments de nobles de servei es van unir a Bolotnikov, que s'oposava al tsar boiar Shuisky. L'alt governador de Ryazan, Prokopy Lyapunov, i el més jove, Grigory Sumbulov, dirigien la milícia de Ryazan, el centurió estrel·lit Istoma Pashkov, un gran destacament de gent del servei. Tula, Kashira, Kaluga, Mozhaisk, Vyazma, Vladimir i Astrakhan es van revoltar. Al Volga, els mordovians i Mari (Cheremis) es van rebel·lar, van assetjar Nijni Novgorod.
Els rebels de camí a Moscou es van apropar a Kolomna. L'octubre de 1606, Posad Kolomna va ser presa per atac, però el Kremlin va continuar resistint. Deixant una petita part de les seves forces a Kolomna, Bolotnikov es va dirigir per la carretera de Kolomna fins a Moscou. Al poble de Troitskoye, districte de Kolomensky, va aconseguir derrotar les tropes governamentals. El 22 d'octubre, l'exèrcit de Bolotnikov estava estacionat al poble de Kolomenskoye, prop de Moscou. Aquí va construir una presó (fortalesa) i va començar a enviar cartes a Moscou i diverses ciutats, cridant a donar suport al sobirà legítim Dmitri Ivanòvitx i despertant als pobres i desafavorits contra els rics. “Tots vosaltres, esclaus boiaris, colpeu els vostres boiars, agafeu les seves dones i totes les seves propietats, finques i finques! Seràs gent noble, i tu, que es deia espies i anònims, mates convidats i comerciants, reparteix el ventre entre vosaltres! Vas ser l’últim, ara rebràs boiaris, astucies, voivodat! Besa tota la creu al sobirà límit Dmitri Ivanòvitx! Per tant, el camí de les tropes de Bolotnikov va anar acompanyat de terribles pogroms, la gent va respondre amb terror al terror, va lluitar com si hi hagués desconeguts al voltant (les tropes tsaristes dels territoris envoltats de revoltes van actuar de manera similar).
La milícia de Bolotnikov va continuar creixent, separant destacaments, principalment dels esclaus, que, amb les seves incursions i robatoris, mantenien la capital en un estat de setge, en van destacar. Al novembre, els cosacs d'Ileika Muromets es van unir a Bolotnikov. Va ser un altre impostor, fent-se passar per Tsarevich Peter Fyodorovich, que en realitat mai va existir el fill del tsar Fiodor I Ivanovitx. Els moscovites ja estaven disposats a obeir Bolotnikov, demanant només que els mostressin a Tsarevich Dmitry, i fins i tot van iniciar negociacions amb ell. L'encantat Bolotnikov va enviar missatgers a Putivl. Per exemple, que el "tsar" vingui abans, la victòria és a prop. Però Dmitry no es va presentar mai. Molts van començar a expressar dubtes sobre l'existència de Dmitry i van passar al costat de Shuisky.
Mentrestant, Shuisky no es va quedar quiet i es preparava activament per a un contraatac. Els suburbis i els assentaments de Moscou van ser fortificats. Les tropes dels governadors Skopin-Shuisky, Golitsyn i Tatev es van establir a la porta de Serpukhov, des d’on observaven el campament enemic. Es va establir una comunicació entre Moscou i les ciutats dels voltants, les tropes vigilaven les carreteres. Al novembre, van arribar els reforços de Tver i Smolensk, que estaven formats en gran part per nobles i ciutadans. Al mateix temps, Shuisky negociava activament amb la part noble del camp rebel. Els Lyapunov i Pashkov odiaven Shuisky, però temien una revolta de la "canalla".
L'exèrcit de Bolotnikov va créixer fins a 100 mil persones (les seves tropes operaven sobre un vast territori), però les seves qualitats de combat van caure. Entre els rebels, hi havia molts esclaus, rodamons, camperols que no tenien experiència en combat, estaven mal armats i organitzats. Cosacs i nobles: dos nuclis de combat de l'exèrcit, van ser menyspreats. Tot i això, també es van oposar. Com a resultat, es va produir una escissió a l'exèrcit de Bolotnikov: un camp estava format per nobles i nens bojars, l'altre: esclaus, cosacs i altres persones. Aquests últims tenien Ivan Bolotnikov com a líders, el primer: Istoma Pashkov i els germans Lyapunov. Van sorgir desacords entre els líders, com a resultat, primer els Lyapunov, i després Istoma Pashkov, van passar al costat de Shuisky. Mentrestant, Shuisky va fortificar fortament Moscou i va formar un nou exèrcit a partir de les milícies d'altres ciutats. A més, Shuisky va atreure a molts nobles del camp de Bolotnikov, prometent-los una recompensa i rangs.
En veure que la situació empitjora i les forces de Shuisky creixien, Bolotnikov va decidir atacar. El 26 de novembre, va intentar prendre el monestir Simonov, però va ser derrotat per les tropes tsaristes sota el comandament d'un jove i talentós comandant, el nebot del tsar Mikhail Skopin-Shuisky. En el moment decisiu de la batalla, un gran destacament noble de Pashkov va abandonar el camp dels rebels, cosa que va decidir el resultat de la batalla a favor de l'exèrcit tsarista. Les tropes de Bolotnikov estaven atrinxerades al camp de Kolomna. Skopin-Shuisky va assetjar els bolotnikovites i va començar a bombardejar. El tsar Vasili va intentar arribar a un acord amb el mateix Bolotnikov, va prometre un alt rang, però el líder dels rebels es va negar a anar a la pau. Després de tres dies de foc d’artilleria, l’exèrcit multicolor de Bolotnikov no va poder suportar-lo i va fugir. Una part dels cosacs es va apoderar del poble de Zaborie, on el 2 de desembre els rebels van ser derrotats de nou. Els cosacs d'Ataman Bezzubtsev van passar al costat de Skopin-Shuisky. El tsar Vasili els va perdonar. La resta de presoners presos a la batalla o durant el vol van ser penjats o atordits amb maces, ofegats. Bolotnikov va fugir a Serpukhov i després Kaluga, Ileika Muromets, va anar a Tula.
Així, els rebels mai van poder prendre la capital. En la batalla decisiva, els bolotnikovites van ser derrotats pels voivodes tsaristes, cosa que va ser facilitada per la traïció dels nobles destacaments que van passar al bàndol del tsar Vasily Shuisky.
A Kaluga, Bolotnikov va reunir prop de 10 mil persones. Fou assetjada per les tropes tsaristes. No obstant això, el comandant principal era el germà sense talent del tsar Ivan Shuisky. Com a resultat, el setge de Kaluga es va allargar des de desembre de 1606 fins a maig de 1607. Els rebels es van defensar amb habilitat i desesperació, van rebutjar atacs, van fer atrevides sortides, causant grans danys a les tropes tsaristes. Els governants tsaristes van decidir cremar la fortalesa de fusta i, després d'haver mobilitzat els camperols dels voltants, van començar a subministrar llenya amb la qual foraven les parets. No obstant això, els rebels van endevinar aquest pla i van fer esclatar "l'escombrada", matant i mutilant a un gran nombre de guerrers tsaristes. En aquest moment, altres rebels van intentar desbloquejar Kaluga, però van ser derrotats. Així, el destacament de Mezetski, enviat des de Putivl per Xakhovski al rescat de Bolotnikov, fou derrotat per l’exèrcit d’Ivan Romanov al riu. Vyrke.
Més tard, les tropes de Telyatevsky i Pseudo-Peter van intentar obrir-se pas cap a Bolotnikov. L'1 de maig de 1607, els cosacs de Don i d'Ucraïna van derrotar les tropes tsaristes al riu Pchelna. Aprofitant la confusió entre l'exèrcit del setge, Bolotnikov va sortir i va derrotar els governadors tsaristes, que es van retirar, abandonant l'artilleria i el tren d'equipatges. Part de les tropes tsaristes van passar al bàndol dels rebels. Només el regiment de Skopin-Shuisky es va retirar en perfecte ordre. Després d'això, Bolotnikov es va traslladar a Tula, on hi havia una fortalesa de pedra més poderosa, i es va unir a altres destacaments rebels.
Llavors Bolotnikov va començar la segona campanya contra Moscou. Tanmateix, el tsar Vasili no es va quedar de braços creuats. Es va anunciar la mobilització de gent "tribut" ("tribut" - guerrers convocats per la gent de la ciutat i les comunitats camperoles) a tot el país i va liderar personalment un gran exèrcit que s'estava formant a Serpukhov. Els centres de l'aixecament van anar esclafant-se progressivament. Els antiavalots van ser expulsats de Nizhny Novgorod. A. Golitsyn va derrotar Telyatevsky a prop de Kashira. L'aparició d'algun Peter desconegut en lloc de l'esperat "bon tsar" Dmitry, que va desencadenar el terror contra els oponents, va refredar a molts, les ciutats rebels es van calmar i van confessar. Al maig, l'exèrcit tsarista es va dirigir cap als rebels. El mateix tsar va participar a la campanya i els regiments van ser comandats per Mikhail Skopin-Shuisky, Pyotr Urusov, Ivan Shuisky, Mikhail Turenin, Andrei Golitsyn, Prokopy Lyapunov i Fyodor Bulgakov.
Els bolotnikovites van intentar obviar les forces principals de l'exèrcit tsarista i anar a Moscou, però obviant Kashira, els rebels es van trobar amb el flanc de l'exèrcit tsarista al riu Vosma. El 5-7 de juny de 1607 es va produir una batalla. Els bolotnikovites tenien un avantatge en força: 30-38 mil soldats. No obstant això, el governador de Tula va trair a Bolotnikov i amb 4 mil. el destacament va passar al costat de les tropes tsaristes. I els destacaments Ryazan de Lyapunov van entrar a la rereguarda de l'exèrcit de Bolotnikov. Això va provocar pànic entre els bolotnikovites i es van retirar. Part de les tropes de Bolotnikov va ser tallada i capturada, els presoners van ser executats. Després de la batalla de Vosemsk, l'exèrcit de Bolotnikov va ser conduït de nou a Tula.
El tsar Vasili Shuisky va enviar diversos regiments dirigits per Mikhail Skopin-Shuisky a Bolotnikov. Als afores de Tula, Bolotnikov va decidir lluitar al riu Voronya, els rebels es van tancar amb serifs i van rebutjar durant molt de temps l’atac de la cavalleria del tsar. Ambdues parts van patir fortes baixes. No obstant això, els arquers van fer una maniobra de rotonda, els bolotnikovites van vacil·lar i van córrer, molts van morir durant la persecució. Bolotnikov va perdre la meitat de les seves tropes en aquestes batalles: unes 20 mil persones. Amb la resta, es va tancar a Tula. Així, Bolotnikov va patir una derrota decisiva i va perdre la iniciativa estratègica.
El 30 de juny, el mateix tsar Vasili amb l'exèrcit principal es va apropar a Tula. Els contemporanis van informar que l'exèrcit tsarista sumava entre 100 i 150 mil persones. A Bolotnikov i "Tsarevich Peter" no els queden més de 20 mil persones. Les armes de setge van començar a bombardejar la ciutat des dels dos bancs. No obstant això, Tula tenia fortificacions poderoses i Bolotnikov es va quedar amb el nucli més eficient dels rebels. Per tant, els assetjats es van mantenir fins a l’octubre de 1607. En les primeres etapes del setge, els defensors de la ciutat van fer sortides i es van defensar amb valentia. Tots els intents dels governadors tsaristes de prendre la ciutat per tempesta van resultar fracassats.
Aleshores, les tropes tsaristes, per la idea del fill Murom del boiar Ivan Krovkov, van decidir bloquejar el riu Upu sota la ciutat amb una presa perquè Tula quedés inundat. A la riba pantanosa dreta, es va aixecar una presa de prop de mig quilòmetre, que suposadament impediria que el riu desbordés a les terres baixes durant la riuada de la tardor, però que provocés un fort augment del nivell de l'aigua. De fet, la riuada de tardor va tallar completament la ciutat del món exterior, convertint-la en una illa pantanosa enmig d’una plana completament inundada. Es van danyar moltes municions, així com els subministraments de gra i sal emmagatzemats als cellers. Aviat va començar una terrible fam i epidèmia a Tula, que va agreujar les contradiccions internes entre els rebels. Els rebels van intentar explotar la presa, però el mateix Kravkov va advertir Shuisky i l'intent va fracassar.
Bolotnikov va enviar missatgers a Mikhail Molchanov i Grigory Shakhovsky més d'una vegada durant el setge, però sense èxit. I el tsar Vasili es va enfrontar a una nova amenaça. Va aparèixer un nou impostor: el fals Dmitri II, que ja havia aconseguit apoderar-se de la terra de Severshchina, Bryansk i Verkhovskaya. A Bolotnikov se li van oferir negociacions sobre les condicions de la rendició de la ciutat. Shuisky va prometre preservar la llibertat dels líders i participants de la revolta. L'acord assolit es va segellar amb un solemne jurament i el 10 d'octubre de 1607 Tula va obrir les seves portes a l'exèrcit del tsar.
El tsar Vasili va enganyar els líders de la revolta. Shuisky es va afanyar a anunciar que el perdó només s'aplica als "interns de Tula" ordinaris, i no als líders de l'aixecament. Els Tulyak van ser realment perdonats, els nobles rebels van sortir amb els exiliats. Xakhovski va ser tonsurat un monjo. "Tsarevich Peter" va ser penjat. Bolotnikov va ser enviat a Kargopol i secretament ofegat. Molts rebels ordinaris van ser enviats a les ciutats i els que van acabar a Moscou, sense soroll ni pols, van ser escanyats.
Així, el govern de Moscou va extingir la guerra camperola mobilitzant pràcticament totes les reserves i responent amb terror al terror. Tanmateix, Shuisky, després d’haver dissolt la major part de l’exèrcit i pensar que l’agitació s’acabaria, va calcular malament. Tot tot començava. Va aparèixer un segon Fals Dmitry, al qual es van unir les restes dels bolotnikovites. Polònia es va tornar a activar.